В 2003-2008 годах управление образования администрации Ейского района сосредоточило свои усилия на разработке и осуществлении механизмов запуска процессов модернизации районной системы образования в соответствии с Концепцией, утвержденной распоряжением Правительства Российской Федерации от 29 декабря 2002 года № 1756-р, КПМО.
В области общего образования в 2003-2008 году управление образования сосредоточило свои усилия на решении задач по следующим направлениям развития районной системы образования:
- программа "Одаренные дети";
- обеспечение адресной социальной поддержки, специальное и реабилитационное образование (подпрограммы «Дети инвалиды», «Дети сироты»);
- охрана жизни и здоровья школьников (подпрограммы «Оснащение медицинских кабинетов», «Оснащение спортивных залов и кабинетов лечебной физкультуры», «Летний отдых и оздоровление школьников»);
- укрепление материально-технической базы образования (подпрограммы «Школьный автобус», «Фонд развития»);
- информатизация и компьютеризация системы общего образования (Программа «Компьютеризация сельских школ»);
- разработка механизмов реализации Концепции модернизации российского образования (Эксперимент по ЕГЭ);
- создание новых информационных ресурсов